苏州吴县香山人，祖上世代为香山帮建筑匠人。

1949年出生于苏州吴县香山地区（现属吴中区），从16岁开始便随父亲学艺，从事香山建筑木作。高祖父为姚三星，在嘉兴开有自己的作坊，曾祖父姚桂庆、叔曾祖姚根庆也均为木作名师，在木渎开作坊，叔祖父姚建祥、姚龙祥、姚龙泉则分别在东山、木渎开过建筑木工作坊，父亲陆文安因跟太祖母姓陆，更是一代香山帮木作名师。

他擅长建筑设计，曾参与枫桥、寒山寺等多处苏州古典名园的维修和修复工程，省建工名人志有记载。陆耀祖从小得到父陆文安亲授，并长期在一起工作，直至陆文安过世，在传统建筑的大木作、木装修方面系统地得到继承，由于香山帮营造技艺书籍很少，长期依赖于师徒口头授教形式，在长期的与父亲一起工作期间，他比较勤奋刻苦，潜心专研技术，因此得到了一些香山帮古典建筑的真传。